McCartney sagte: „Ich wollte mit einem kleinen bedeutungsvollen Couplet enden, also folgte ich dem Barden und schrieb ein Couplet.“ In seinem Interview mit dem Playboy von 1980 erkannte John Lennon die Urheberschaft McCartneys an, indem er sagte: „Das ist wieder Paul … Er hatte eine Zeile darin, ‚Und am Ende ist die Liebe, die man bekommt, gleich der Liebe, die man gibt‘, was eine sehr kosmische, philosophische Zeile ist. Was wiederum beweist, dass er, wenn er will, denken kann. Lennon hat die Zeile falsch zitiert; der eigentliche Text lautet: „And in the end, the love you take, is equal to the love you make…“
Die Aufnahmen begannen am 23. Juli 1969, als die Beatles einen einminütigen, dreißigsekündigen Master-Take aufnahmen, der durch Overdubs auf zwei Minuten und fünf Sekunden erweitert wurde. Zu diesem Zeitpunkt hieß der Song „Ending“. Der erste Gesang des Songs wurde am 5. August hinzugefügt, weitere Gesangs- und Gitarren-Overdubs am 7. August und Bass und Schlagzeug am 8. August, dem Tag, an dem das Abbey Road-Coverfoto aufgenommen wurde. Orchester-Overdubs wurden am 15. August hinzugefügt und das abschließende Klavier und der begleitende Gesang am 18. August.
Alle vier Beatles haben ein Solo in „The End“, einschließlich eines Ringo Starr Schlagzeugsolos. Starr mochte keine Soli, er zog es vor, die Schlagzeugarbeit auf denjenigen abzustimmen, der bei einem bestimmten Auftritt sang. Sein Solo auf „The End“ wurde mit zwölf Mikrofonen um sein Schlagzeug herum aufgenommen; er sagte, er habe bei seinem Spiel einen Teil von Ron Bushys Schlagzeugspiel auf dem Iron-Butterfly-Titel „In-A-Gadda-Da-Vida“ kopiert. Der Take, in dem Starr das Solo spielte, hatte ursprünglich eine Gitarren- und Tamburinbegleitung, aber die anderen Instrumente wurden beim Abmischen stummgeschaltet, so dass der Effekt eines Schlagzeugsolos entstand.
McCartney, George Harrison und Lennon spielen eine abwechselnde Folge von drei zweitaktigen Gitarrensoli. Die Idee für ein Gitarren-Instrumental über diesem Abschnitt stammte von Harrison, und Lennon schlug vor, dass die drei jeweils einen Abschnitt spielen sollten. Die Soli beginnen etwa 53 Sekunden nach Beginn des Liedes. Geoff Emerick, der Aufnahmetechniker der Beatles, erinnerte sich später: „John, Paul und George sahen aus, als wären sie in der Zeit zurückgereist, als wären sie wieder Kinder, die nur aus Spaß an der Freude zusammen spielen. Mehr als alles andere erinnerten sie mich an Revolverhelden, mit ihren umgeschnallten Gitarren und ihrem entschlossenen Blick, entschlossen, sich gegenseitig zu übertreffen. Und doch gab es keine Feindseligkeit, keine Spannung – man merkte, dass sie einfach Spaß hatten.“
Die ersten beiden Takte werden von McCartney gespielt, die zweiten beiden von Harrison und die dritten beiden von Lennon, dann wiederholt sich die Abfolge. Jeder hat einen eigenen Stil, der nach McCartneys Meinung ihre Persönlichkeit widerspiegelt. Unmittelbar nach Lennons drittem Solo setzen die Klavierakkorde der letzten Zeile „And in the end …“ ein. Dann übernimmt das Orchesterarrangement mit einem summenden Refrain und Harrisons abschließendem Gitarrensolo, das den Song beendet.
„The End“ sollte ursprünglich das letzte Stück auf Abbey Road sein, wurde dann aber von „Her Majesty“ abgelöst. Obwohl „The End“ die letzte bekannte neue Aufnahme ist, an der alle vier Mitglieder der Beatles beteiligt waren, wurde ein weiterer Song, „I Me Mine“, im Januar 1970 von drei Mitgliedern der Gruppe (Lennon war abwesend, weil er im September 1969 die Gruppe privat verlassen hatte) für das Album Let It Be aufgenommen.
Das 1996 erschienene Kompilationsalbum Anthology 3 enthält eine neu abgemischte Version von „The End“, bei der die aus dem Original herausgemischten Tamburin- und Gitarren-Overdubs wiederhergestellt und so bearbeitet wurden, dass die Gitarrensoli und der Orchester-Overdub hervorgehoben wurden. Auf das Stück folgt eine Variante des langen Klavierakkords, mit dem „A Day in the Life“ endet und der die Zusammenstellung abschließt. Das Schlagzeugsolo wurde später zu Beginn von „Get Back“ auf dem 2006 erschienenen Album Love verwendet.