Honduras ocupă o suprafață de 112.492 km pătrați (43.433 mp) în America Centrală. După cum se observă pe harta fizică a Hondurasului, țara are trei regiuni topografice majore. Acestea sunt un vast platou interior de dealuri și munți care domină peisajul; câmpiile joase din Caraibe și câmpiile joase din Pacific- care mărginesc Golful Fonseca.
Colinele interioare împădurite și Munții Sierra Madre sunt străbătute de o serie mare de râuri și văi largi și fertile; mărginite de plaje de nisip. Cerro Las Minas, cu o înălțime de 2.870 m, situat în partea de vest a țării, este cel mai înalt punct din Honduras.
Pământurile joase din Caraibe se întind de-a lungul întregii sale coaste nordice, iar acolo, în nord-est, așa cum este marcat pe hartă, Coasta Țânțarilor este o întindere largă și nelocuită de junglă deasă, lagune și mlaștini de mangrove.
Pământurile joase din Pacific înconjoară Golful Fonseca, iar acel teren devine, de asemenea, oarecum mlăștinos în apropierea coastei. Țara are numeroase golfuri și insule în Marea Caraibelor, inclusiv Isla de la Bahia (Insulele Golfului), micile Cayos Cocinos (Insulele Porcului) și îndepărtatele Insule Swan. În Golful Fonseca se află câteva insule vulcanice adormite de mult timp, printre care Tigre și Zacate.
Honduras este bogată în apă; cele mai importante râuri includ Aquan, Coco, Patuca, Sico și Ulua; lacul Yojoa este singurul lac semnificativ, iar laguna Caratasca din nord-est este cea mai mare dintre numeroasele lagune de coastă.
.