Alle, zwany także allelomorfem, jeden z dwóch lub więcej genów, które mogą występować alternatywnie w danym miejscu (locus) na chromosomie. Allele mogą występować parami, lub może być wiele alleli wpływających na ekspresję (fenotyp) danej cechy. Kombinacja alleli posiadanych przez organizm stanowi jego genotyp. Jeśli sparowane allele są takie same, genotyp organizmu określa się jako homozygotyczny dla danej cechy; jeśli są różne, genotyp organizmu jest heterozygotyczny. W parze heterozygotycznej allel dominujący będzie nadrzędny w stosunku do cech allelu recesywnego. W przypadku niektórych cech allele mogą być jednak kodominujące, tzn. żaden z nich nie jest ani dominujący, ani recesywny. Przykładem jest ludzki system grup krwi ABO; osoby z grupą krwi AB mają jeden allel dla A i jeden dla B. (Osoby z żadną z tych grup nie są grupą O.)
Większość cech jest określana przez więcej niż dwa allele. Może istnieć wiele form allelu, ale tylko dwie z nich przyłączą się do wyznaczonego miejsca w genie podczas mejozy. Ponadto, niektóre cechy są kontrolowane przez dwa lub więcej miejsc genowych. Obie możliwości zwielokrotniają liczbę zaangażowanych alleli. Wszystkie cechy genetyczne są wynikiem interakcji między allelami. Mutacje, crossing over i warunki środowiskowe selektywnie zmieniają częstość występowania fenotypów (a tym samym ich alleli) w populacji. Na przykład, allele przenoszone przez osobniki o wysokiej sprawności (co oznacza, że z powodzeniem rozmnażają się i przekazują swoje geny potomstwu) mają większe prawdopodobieństwo przetrwania w populacji niż allele przenoszone przez osobniki o gorszej sprawności, które z czasem są stopniowo tracone z populacji.
.