Jogi problémák
2002-ben Kelly és Jay-Z kiadta a The Best of Both Worlds című közös albumát. A lemezt azonban beárnyékolta Kelly állítólagos szexbotrányba keveredése. Egy videó, amelyen állítólag Kelly egy kiskorú lánnyal szexelt, egy újságíró kezébe került, aki átadta a felvételt a rendőrségnek. Kelly azt állította, hogy ártatlan.
2002 júniusában Kelly ellen 21 rendbeli gyermekpornográfiával kapcsolatos bűncselekmény miatt emeltek vádat Illinois államban. A következő évben Floridában ismét vádat emeltek ellene hasonló vádakkal, de ezeket később ejtették.
A botrányok ellenére Kelly továbbra is nagy kereskedelmi sikert aratott. A 2004-es Happy People/U Saved Me című albumából több mint 2 millió példányt adtak el, és 2005-ben a TP.3 Reloaded című lemezen bemutatta híres kapcsolódó dalsorozatát, a Trapped in the Closet címűt. Emellett továbbra is keresett kollaboráns maradt, többek között Snoop Dogggal és Ja Rule-lal dolgozott együtt.
Kellyt végül 2008 májusában állították bíróság elé. Ekkorra az ellene felhozott vádak közül többet ejtettek. Akkor a fiatal nő, aki állítólag szerepelt a videóban, megtagadta a tanúvallomást, és több családtagja is azt állította, hogy nem ő szerepelt a videóban. Többhetes tanúvallomás után az esküdtszék arra a következtetésre jutott, hogy Kelly nem bűnös az ellene felhozott 14 vádpont mindegyikében.
Back in the Studio and Autobiography
Bár már nem az a vezető sztár, aki egykor volt, R. Kelly továbbra is új zenét készített és élőben is fellépett. 2012-ben kiadta a Write Me Back című albumát, amely olyan sztárok nyomdokaiba lépett, mint Marvin Gaye és Teddy Pendergrass.
Még ugyanebben az évben Kelly megjelentette önéletrajzi könyvét, a Soulacoaster-t: The Diary of Me című könyvét. Kelly a könyv megírásának okát a weboldalán azzal magyarázta, hogy “úgy érezte, itt az ideje, hogy megismerjék Robertet, a mama fiát, Robertet, a testvért, Robertet, az apát és legfőképpen Robertet, az embert.”
Kelly 2013-ban adta ki következő albumát, a Black Panties-t, majd két évvel később a The Buffet követte. 2016-ban egy ünnepi sztenderdeket tartalmazó albumot adott ki 12 Nights of Christmas címmel.
Még több szexuális visszaéléssel kapcsolatos vád
2018-ban Kelly ismét forró vízbe került személyes ügyei miatt a BBC R. Kelly című dokumentumfilmjének megjelenésével: Szex, lányok és videokazetták. A dokuban Kelly egy korábbi barátnője azt állította, hogy az énekes “ápolta” őt, hogy szexeljen más nőkkel, akik közül az egyikük mindössze 14 éves volt.
Áprilisban egy újabb fiatal nő állt elő Kelly elleni vádakkal. Ügyvédje szerint a nő 2017 júniusában, 19 évesen kezdett nyolc hónapos kapcsolatot az énekessel, amely alatt a férfi nemi betegséggel fertőzte meg, és megpróbálta bevonni őt a szexuális partnerei körébe. Az állítólagos áldozat már panaszt tett a dallasi rendőrségen, és arra készült, hogy szövetségi polgári feljelentést tegyen Kelly ellen.
Még abban a hónapban Kelly a Time’s Up nevű szervezet célkeresztjébe került, amelyet befolyásos művészek és vezetők hoztak létre a szexuális zaklatás áldozatainak védelmére. A szervezet nyílt levelet tett közzé, amelyben “megfelelő vizsgálatokat és vizsgálatokat követelt az R. Kelly által színesbőrű nők és családjaik által immár több mint két évtizede tett, R. Kelly visszaélésére vonatkozó vádakkal kapcsolatban”, és felszólította az olyan vállalatokat, mint az RCA, a Spotify, az Apple és a Ticketmaster, hogy szakítsák meg vele a szakmai kapcsolataikat.
2018 májusában a Spotify törölte R. Kelly-t az összes lejátszási listájáról az új gyűlöletkeltő tartalmakra vonatkozó & gyűlöletkeltő magatartási politikája miatt, hogy “összhangban legyen a zenében és a médiában betöltött különböző szerepeinkkel.”
Dokumentumfilmek és letartóztatás
2019 januárjában a Lifetime hatrészes dokumentumfilmet sugárzott Surviving R. Kelly, amely a barátnőkkel és munkatársakkal készített interjúkon keresztül tárta fel az évek során ellene felhozott vádakat.
Röviddel ezután az RCA kirúgta az ellentmondásos énekest a kiadójától. Februárban Michael Avenatti ügyvéd nyilvánosságra hozta, hogy átadott a hatóságoknak egy videokazettát, amelyen állítólag Kelly szexuális tevékenységet folytat egy kiskorú lánnyal.
Február 22-én, egy nappal azután, hogy két újabb nő jelentkezett a vádakkal, Kelly ellen hivatalosan is vádat emeltek 10 rendbeli súlyos szexuális zaklatás bűntette miatt az Illinois állambeli Cook megyében. Még aznap este feladta magát a chicagói rendőrségen, és három nappal később elhagyta a börtönt, miután letette a 100.000 dolláros óvadékot.
Kelly március 5-én felbukkant a CBS This Morning című műsorának Gayle Kingnek adott, igen feszült interjúra, egy ponton megállt, a kamerába kiabált és sírt, miközben ártatlanságát hirdette. Azt is elutasította, hogy a nőket akaratuk ellenére egy szexszektában tartaná fogva, és azt mondta, hogy a vele élő két fiatal nőt a szüleik “adták át”.
A művészt 2019 júliusában ismét letartóztatták, ezúttal egy sor szövetségi váddal, amelyek között szerepelt a szexkereskedelem és a gyermekpornográfia előállítása is.
2020 januárjában a Lifetime bemutatta a Surviving R. Kelly Part II: The Reckoning című filmet. A Kelly állítólagos áldozataival készített további interjúk mellett ez a sorozat azokat a fenyegetéseket és stresszt vizsgálta, amelyeket az előző dokumentumfilmben az énekes ellen felszólaló nők elszenvedtek.