Braugherova první filmová role byla ve filmu Glory z roku 1989 v roli Thomase Searlese, svobodného, vzdělaného černocha ze Severu, který se připojí k prvnímu černošskému pluku v armádě Unie. Koncem 80. let hrál Kojakova pomocníka v obnoveném televizním filmu televize ABC Kojak. Následně přešel k roli v televizním seriálu Vraždy: Život na ulici jako detektiv Frank Pembleton, samolibý, vznětlivý, neústupný, jezuitsky vzdělaný policejní detektiv. Braugher hrál po boku Kylea Secora (který ztvárnil detektiva Tima Baylisse) a stal se průlomovou hvězdou seriálu. V letech 1997 a 1998 získal cenu Asociace televizních kritiků za individuální úspěch v dramatickém žánru. V letech 1996 a 1998 byl nominován na cenu Primetime Emmy za vynikajícího herce v hlavní roli v dramatickém seriálu a v posledním roce zvítězil. Po šesté sezóně seriálu Homicide odešel, ale vrátil se pro reunionový televizní film. Hrál také ve filmech Město andělů, Frequency a Poseidon. V roce 1997 byl časopisem People vybrán mezi „50 nejkrásnějších lidí světa“.
V rámci cyklu Shakespeare in the Park v divadle Delacorte Theater v newyorském Central Parku hrál Braugher v roce 1996 titulní roli v inscenaci Jindřicha V., za kterou obdržel cenu Obie. V roce 2000 hrál titulní roli Bena Gideona v seriálu Gideon’s Crossing, který trval jednu sezónu. V roce 2002 Braugher vyprávěl oceňovaný dokumentární film Muhammad, který vysílala PBS: Legacy of a Prophet, který produkovala nadace Unity Productions a který byl nedávno znovu vydán. Braugher také pro PBS vyprávěl film The Murder of Emmett Till. V letech 2002-2004 hrál detektiva Marcelluse Washingtona v televizním seriálu Hack. V roce 2006 si Braugher zahrál Nicka Atwatera v minisérii Thief pro FX Networks a za svůj výkon získal druhou cenu Emmy. V roce 2007 ztvárnil generála Hagera ve filmu Fantastická čtyřka:
Braugher se objevil v seriálu House, M.D. jako Dr. Darryl Nolan, psychiatr, který pomáhá Housovi vyléčit se ze závislosti na Vicodinu. Objevil se také v seriálu TNT Muži určitého věku, za který byl dvakrát nominován na cenu Primetime Emmy za vynikajícího herce ve vedlejší roli v dramatickém seriálu. Namluvil také hlas padoucha Darkseida v animovaném filmu Superman/Batman: Apokalypsa. Braugher hrál jednu z hlavních rolí v inscenaci The Whipping Man v Manhattan Theatre Club, která se hrála mimo Broadway v omezeném počtu představení od ledna do března 2011. V letech 2006-2010 vyprávěl na stanici NBC úvod k olympijským hrám a vystřídal v této roli Jamese Earla Jonese. Braugher také vyprávěl knihu Jamese Pattersona Alex Cross Cross Fire (2010).
V seriálu Zákon &pořádek má opakující se roli obhájce Bayarda Ellise: Marcus Chaplin se objevil jako hlavní postava kapitána Marcuse Chaplina ve vojenském dramatickém seriálu televize ABC Last Resort. Braugher měl také stálou roli ve 4. sérii animovaného seriálu BoJack Horseman společnosti Netflix jako kalifornský guvernér Woodchuck Coodchuck-Berkowitz. V současné době hraje v televizním seriálu Brooklyn Nine-Nine, oceněném Zlatým glóbem, roli kapitána okrsku Raymonda Holta, za kterou byl čtyřikrát nominován na cenu Primetime Emmy za vynikající herecký výkon ve vedlejší roli v komediálním seriálu.