Das NCBI testet eine neue Methode, um orthologe Wirbeltiergene zu finden und abzurufen. Um Orthologe zu finden, geben Sie ein Gensymbol (z.B. RAG1) oder ein Gensymbol in Kombination mit einer taxonomischen Gruppe (z.B. Primat RAG1) ein. Wählen Sie den passenden Eintrag aus dem Vorschlagsmenü oder wählen Sie die Option Orthologe (z. B. Rag1 Orthologe), um alle Orthologe anzuzeigen. Ihre Suche liefert einen Ergebnislink zu den Orthologen, die von der Gen-Ressource des NCBI bereitgestellt werden. Klicken Sie auf den Ergebnislink, um Informationen zu dieser Ortholog-Gruppe anzuzeigen (Abbildung 1).
Abbildung 1. Suche nach Rag1-Orthologen mit dem Link zum Satz von RAG1-Genen aus Wirbeltieren.
Auf der Ortholog-Seite (Abbildung 2) können Sie Transkript- oder Proteinsequenzen zum Herunterladen oder Alignment auswählen, den Taxonomiebaum zur Verfeinerung Ihrer Ergebnisse verwenden und bis zur Art-Ebene vordringen. Sie finden detailliertere Geninformationen mit Links zu BLAST und GDV, dem Genombrowser des NCBI. Sie erhalten auch schnellen Zugang zu Literatur aus PubMed, die auf Ihrer Auswahl basiert.
Abbildung 2. Der Satz von RAG1-Orthologen für Kieferwirbeltiere mit Links zu Genen, Referenzsequenzen, Sequenz-Download und Alignment. Die Registerkarte Literatur bietet relevante PubMed-Zitate für die ausgewählten Orthologe. Der Taxonomie-Baum ermöglicht es Ihnen, schnell detaillierte Ergebnisse für eine bestimmte Spezies, wie z. B. den Rhesusaffen, zu finden.
Wenn Sie auf der Suche nach einer Reihe von orthologen Genen sind, probieren Sie es aus und lassen Sie uns wissen, was Sie denken. Bleiben Sie dran für Updates!