Le jeu s’écarte du gameplay traditionnel de la série Mario Kart, où l’objectif est d’atteindre la ligne d’arrivée en premier ; ce jeu utilise un système basé sur des points. Il existe quatre options de vitesse : 50cc (à savoir « tranquille »), 100cc (« rapide »), 150cc (« très rapide ») et 200cc (« trop rapide »). Contrairement aux précédents opus de la série, une grande partie de la conduite (notamment l’accélération et les sauts) est effectuée automatiquement. Mario Kart Tour reprend des caractéristiques des précédents jeux Mario Kart, comme la course sous l’eau et le deltaplane de Mario Kart 7. Ce jeu introduit un nouveau mode Frenzy, qui se produit lorsqu’un pilote obtient trois objets identiques dans une boîte d’objets. Chaque personnage peut obtenir un objet unique (également appelé « compétence spéciale ») à partir des boîtes d’objets.
Mario Kart Tour introduit un nouveau format appelé « Tours ». Les tours portent le nom de villes du monde réel, de personnages de la série Mario, de jeux de la série Mario ou d’autres thèmes (comme la cuisine et les vacances). Chaque tour dure deux semaines et commence le mercredi à 6 heures UTC. Au cours d’un tour, les joueurs peuvent s’affronter dans douze à dix-huit coupes et collecter des pilotes, des karts et des planeurs qui représentent les villes ou les thèmes correspondants. Il y a aussi des pilotes, des karts et des planeurs vedettes pendant les deux semaines que dure un tour. Chaque coupe se compose de trois parcours et d’un défi bonus. Les parcours des coupes précédentes peuvent être réutilisés pour les coupes suivantes. La plupart des courses comptent deux tours, tandis que la plupart des défis bonus se font en un tour. Les coupes portent également le nom de certains pilotes du jeu au lieu des éléments habituels de la franchise Mario.
Après avoir terminé une course, le joueur reçoit des Grandes Étoiles pour débloquer des cadeaux de tournée, des pièces et des points d’expérience pour le personnage, le kart et le planeur utilisés. Si le joueur termine dans les trois premiers, il gagne des points de joueur pour son niveau. Si le joueur termine à la 5e place ou en dessous, la jauge de niveau diminuera. Lorsque le joueur remplit complètement la jauge, il passe au niveau supérieur et obtient une récompense. Chaque cours a également une limite de points d’expérience. Actuellement, le niveau maximal du joueur est de 150.
Chaque jour, le joueur peut gagner jusqu’à 450 points d’expérience pour chaque personnage, kart et planeur et 300 pièces en faisant des courses (900 points d’expérience et 600 pièces si le joueur est abonné au Gold Pass). Une fois ces limites atteintes, le joueur ne peut plus obtenir de points d’expérience pour les personnages, les karts et les planeurs, ni collecter de pièces supplémentaires lors des courses quotidiennes jusqu’au lendemain matin à 6h00 UTC. Pour continuer à gagner plus de points d’expérience ou à collecter des pièces, le joueur peut jouer à Coin Rush pour obtenir plus de pièces ou utiliser des tickets de boost de points pour les personnages, les karts et les planeurs.
Sur le défi bonus de chaque coupe, le joueur doit faire l’exigence pour compléter la coupe. Le personnage représenté sur l’image du défi bonus est toujours sélectionné, même si le joueur ne les possède pas encore. La réussite d’un défi bonus permet d’obtenir trois Grandes Étoiles au lieu de cinq. Certains défis permettent également au joueur de choisir n’importe quel personnage, kart et planeur.
Chaque semaine, la coupe d’un tour est un tournoi. 20 joueurs sont placés sur un tableau de classement basé sur le score global de la coupe. Le mercredi suivant, Lakitu annonce les résultats du joueur. Le joueur gagnera des niveaux et des récompenses si sa position finale est proche du sommet, mais il perdra un ou deux niveaux s’il termine mal. Le joueur obtient également une récompense si le score du joueur et de ses amis atteint un certain montant.
Ce jeu comprend des courses contre des adversaires contrôlés par l’IA avec des noms d’utilisateur conçus pour faire croire aux joueurs qu’ils jouent contre d’autres joueurs humains. En outre, un test bêta pour la fonction multijoueur de ce jeu a commencé à partir de » environ 23h00 PT le 18 décembre 2019 à 21h59 PT le 26 décembre 2019 » et n’était disponible que pour les abonnés au Gold Pass. Du 22 janvier 2020 au 28 janvier 2020, il y avait un test multijoueur pour tous les joueurs du jeu.
À 20h PT le 8 mars 2020, la fonction multijoueur de Mario Kart Tour a été officiellement lancée. Tous les joueurs « peuvent courir contre jusqu’à sept autres joueurs, qu’ils soient enregistrés en tant qu’amis dans le jeu, à proximité de votre emplacement, ou même dispersés dans le monde entier. » En attendant, « les Gold Races sont exclusivement réservées aux abonnés du Mario Kart Tour Gold Pass ». L’une des principales différences entre les courses standard (pour les joueurs qui n’ont pas le Gold Pass) et les courses Gold est le choix de la vitesse : seule la vitesse 100cc est disponible dans les courses standard, tandis que les 150cc et 200cc sont disponibles dans les courses Gold. Il existe un rang multijoueur (allant de F à A, S à S+6 si vous avez souscrit au Gold Pass) pour chaque joueur. Un pourcentage pour le rang augmentera lorsqu’un joueur gagne dans une course multijoueur, mais diminuera ou restera inchangé lors d’une défaite.
À l’origine, le jeu ne pouvait être joué qu’en mode portrait, cependant le 21 juillet 2020, le jeu a reçu une mise à jour qui permet aux joueurs de jouer en mode paysage également.