血液凝固過程の進行に必要な成分は、すべて血液中に存在します。 そのため、このような凝固が起こるために必要なタンパク質は、血液凝固の内在性経路の一部となっています。 この経路には、一連のタンパク質、タンパク質補因子、酵素が関与しており、これらは膜表面で起こる反応において相互作用する。 これらの反応は、組織の損傷によって開始され、フィブリン凝血塊の形成に至る（図1）。 各タンパク質は活性型として血液中を循環している。 Encyclopædia Britannica, Inc.
固有経路は、ガラスなどの特定の負に帯電した表面による第XII因子の活性化によって開始されます。 高分子キニノーゲンとプレカリクレインがこの活性化を促進する2つのタンパク質である。 第XII因子の酵素型（第XIIa因子）は、第XI因子の酵素型（第XIa因子）への変換を触媒する。 第XIa因子は、カルシウムイオンを必要とする反応において、第IX因子を活性化型である第IXa因子に変換することを触媒する。 第IXa因子は第VIII因子と複合体となって膜表面に集合する。第IXa因子-第VIII因子複合体は、これらのタンパク質の膜結合性に関連したある構造を安定化するためにカルシウムを必要とする。 第X因子は第IXa因子-第VIII因子複合体に結合し、第Xa因子へと活性化される。 第Xa因子は膜表面で第V因子と複合体を形成し、この反応にもカルシウムイオンが必要である。 プロトロンビンは第Xa因子-第V因子複合体に結合し、フィブリノーゲンを切断して単量体のフィブリンにする強力な酵素であるトロンビンに変換される。 そして、単量体のフィブリン分子は互いに結合（重合）して長い繊維を形成する。 その後、第XIIIa因子と呼ばれる酵素によってポリマーのユニット間の結合がさらに促進され、架橋によって新しく形成された血栓を安定化させる。 詳細なメカニズムは不明であるが、このカスケード効果（滝のような効果）により、組織損傷に伴う小さなシグナルが、フィブリン凝固の形成という大きな生物学的事象に増幅される可能性がある。
ガラス、カオリン、いくつかの合成プラスチック、布地など、ある種の負に帯電した表面は、第XII因子を酵素型である第XIIa因子に活性化させる。 一方、ある種の材料は、第XII因子を活性化する傾向がほとんどない。 不活性な表面とは、油、ワックス、樹脂、シリコーン、いくつかのプラスチック、そして最も不活性な表面である内皮細胞などである。 活性を決定する物理化学的特性はわかっていない。 この問題は重要で、現代の外科手術では、心臓弁や血管の一部の代用品（プロテーゼ）を作るために、完全に不活性な材料が必要とされるからである。 これらの表面に血栓が形成されると、重篤な、あるいは致命的な合併症につながる可能性がある。 開心術では、血液凝固プロセスを大きく活性化させない装置で血液を送り出す必要があります。 同様に、腎臓の透析で老廃物を濾過する際にも、フィブリン凝血塊の発生を招くようなことがあってはならない。
本質的経路の活性は、部分トロンボプラスチン時間（PTT）、より正確には活性化部分トロンボプラスチン時間と呼ばれる簡単な臨床検査で評価することができる。 血漿を採取し、クエン酸緩衝液で抗凝固する。クエン酸は血漿中の機能性カルシウムイオンを結合し、効果的に除去する。 この条件下では、フィブリン凝血塊は生成されない。 血漿に珪藻土のカオリンのようなマイナスに帯電した物質を添加する。 カオリンは第XII因子を酵素型である第XIIa因子に活性化し、これが第XI因子を活性化する。 このとき、次の反応である第IX因子の活性化に必要なカルシウムイオンが不足しているため、それ以上の活性化が阻害される。 カルシウムイオンとリン脂質製剤（血液凝固タンパク質複合体の集合のための人工膜の役割を果たす）を添加すると、目に見える血栓が形成されるまでの時間が記録される。 この反応は、使用する薬品の配合にもよるが、25秒から50秒程度で起こる。 実際には、被検血漿の凝固時間は正常血漿の凝固時間と比較される。 部分トロンボプラスチン時間の延長として測定される凝固遅延は、1つ以上の血液凝固因子の活性の欠乏または血液凝固の化学的阻害剤に起因することがある
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