Este trabajo representa un esfuerzo por explorar el origen y las relaciones evolutivas de las poblaciones nativas andinas utilizando un enfoque multidisciplinario. Se revisan brevemente las evidencias arqueológicas y lingüísticas. Un análisis de la distancia genética entre las principales agrupaciones lingüísticas y entre las poblaciones nativas andinas y amazónicas, junto con la información obtenida de fuentes arqueológicas y lingüísticas, se utilizó para generar un modelo de migración. Se sugiere que a finales del Pleistoceno un grupo de cazadores nómadas entró en Sudamérica a través del istmo de Panamá y se dividió después en dos grupos, uno de los cuales se desplazó hacia el sur en las zonas andinas centrales y meridionales y, tras cruzar el altiplano colombiano, ecuatoriano y peruano, para poblar el noroeste de Argentina, el país de los parques abiertos del este de Brasil y las pampas argentinas. El segundo grupo emigró hacia el este, a Venezuela y Guyana, y más tarde hacia el sur, poblando la Amazonia brasileña. Siguiendo las vías de agua disponibles, los indios amazónicos se expandieron hacia el este y el oeste, llegando probablemente a la vertiente oriental de los Andes hace unos 3.500 años. La hipótesis es que los actuales nativos andinos son descendientes de los grupos amazónicos que emigraron hacia el este.