El término morfología en biología se refiere a la forma, estructura y configuración de un organismo. Esto incluye aspectos de la apariencia externa (forma, estructura, color, patrón) así como la forma y estructura de las partes internas como los huesos y órganos. Esto contrasta con la fisiología, que se ocupa principalmente de la función.
La morfología es una rama de las ciencias de la vida que se ocupa del estudio de la estructura bruta de un organismo o taxón y sus partes componentes. Puede subdividirse en dos ramas distintas: la anatomía es el estudio de la estructura y los órganos internos de un organismo. El estudio de la apariencia externa de un organismo se denomina eidonomía, pero aunque predominó en los primeros tiempos de la historia de la biología, ya se estudia poco en particular, ya que está maduro por los efectos de la evolución convergente. Por lo tanto, aporta menos información nueva sobre los organismos que la anatomía y, por lo tanto, la apariencia externa de las formas de vida suele estudiarse como parte de las investigaciones generales en morfología, por ejemplo, en el contexto de la investigación filogenética.
También se utiliza el término «morfología gruesa», que se refiere a los aspectos prominentes o principales de la morfología de un organismo o taxón. Una descripción de la morfología bruta de un organismo incluiría, por ejemplo, su forma general, su color general, sus marcas principales, etc., pero no detalles más finos.
La mayoría de los taxones difieren morfológicamente de otros taxones. Normalmente, los taxones estrechamente relacionados difieren mucho menos que los más distantes, pero hay excepciones. Las especies crípticas son especies que parecen muy similares, o incluso idénticas en apariencia, pero que están aisladas reproductivamente. A la inversa, a veces los taxones no relacionados adquieren una apariencia similar por evolución convergente o incluso por mimetismo. Otro problema que se plantea al basarse en los datos morfológicos es que lo que puede parecer, desde el punto de vista morfológico, dos especies distintas, puede demostrarse, de hecho, mediante el análisis del ADN, que se trata de una sola especie.