Búsqueda de genes ortólogos en el NCBI

El NCBI está probando una nueva forma de encontrar y recuperar genes vertebrados ortólogos. Para encontrar ortólogos introduzca un símbolo de gen (por ejemplo, RAG1) o un símbolo de gen combinado con un grupo taxonómico (por ejemplo, RAG1 de primates). Seleccione la entrada correspondiente en el menú de sugerencias o puede seleccionar la opción de ortólogos (por ejemplo, ortólogos de Rag1) para ver todos los ortólogos. Su búsqueda devolverá un enlace de resultados al conjunto de ortólogos proporcionado por el recurso Gene del NCBI. Haga clic en el enlace de resultados para ver la información de ese grupo de ortólogos (Figura 1).

Figura 1. Búsqueda de ortólogos de Rag1 mostrando el enlace al conjunto de genes RAG1 de vertebrados.

En la página de ortólogos (Figura 2), puede seleccionar secuencias de transcripción o de proteínas para su descarga o alineación, utilizar el árbol de taxonomía para refinar sus resultados y profundizar hasta el nivel de especie. Encontrará información genética más detallada con enlaces a BLAST y GDV, el buscador de genomas del NCBI. También obtendrá acceso rápido a la literatura de PubMed basada en su selección.

Figura 2. El conjunto de ortólogos de RAG1 para los vertebrados con mandíbula con enlaces a Gen, Secuencias de Referencia, descarga de secuencias y alineación. La pestaña de Literatura proporciona citas relevantes de PubMed para los ortólogos seleccionados. El Árbol de Taxonomía le permite encontrar rápidamente resultados detallados para una especie en particular como el mono Rhesus.

Si está buscando un conjunto de genes ortólogos, pruebe esto y háganos saber lo que piensa. Manténgase en sintonía para las actualizaciones!

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