Après traitement post-transcriptionnel, l’ARNm quitte le noyau cellulaire et se lie à un ribosome, une structure composée de protéines et d’ARN (ARNr) qui aide au processus de liaison entre les codons de l’ARNm et les anticodons de l’ARNt. Alors que le ribosome ne peut travailler que sur un brin d’ARNm à la fois, plusieurs ribosomes peuvent se lier à n’importe quel brin d’ARNm pour former des polyribosomes. Les ribosomes eucaryotes et procaryotes diffèrent légèrement par leur taille et leur complexité, mais leur fonction est généralement similaire. Jusqu’à ce que nous abordions les propriétés spécifiques de la traduction eucaryote, nous ne parlerons que de la traduction procaryote.
Structure du ribosome
Les ribosomes sont composés de deux sous-unités, une petite et une grande. Quatre sites de liaison sont situés sur le ribosome, un pour l’ARNm et trois pour l’ARNt. Les trois sites d’ARNt sont appelés P, A et E. Le site P, appelé site peptidyle, se lie à l’ARNt qui contient la chaîne polypeptidique d’acides aminés en croissance. Le site A (site accepteur), se lie à l’ARNt aminoacyle, qui contient le nouvel acide aminé à ajouter à la chaîne polypeptidique. Le site E (site de sortie), sert de seuil, dernière étape transitoire avant qu’un ARNt désormais privé de son acide aminé soit lâché par le ribosome.
Une fois que la petite sous-unité s’associe à une molécule d’ARNm, les deux sous-unités se réunissent, créant un compacteur qui maintient l’ARNm et l’ARNt dans une orientation stable et appropriée pour la synthèse des protéines.
Croissance de la protéine
Si nous regardons la structure chimique d’un acide aminé, nous voyons qu’une extrémité contient un groupe azoté terminal tandis que l’autre contient un groupe carboxyle.
Lorsque les acides aminés sont transférés de l’ARNt aminoacyle du site A à la chaîne protéique en croissance attachée au site P, ils sont transférés dans une orientation spécifique de sorte que la chaîne croît en ajoutant des acides aminés à l’extrémité carboxyle, et non pas azotée, de la chaîne. De cette façon, la chaîne protéique croît dans le sens azote-carboxyle. Cette chaîne synthétisée est appelée chaîne polypeptidique. De même, chaque acide aminé ajouté peut être appelé un peptide ; un élément constitutif de la grande chaîne polypeptidique. Les protéines sont des polypeptides.
