W 1947 roku Mary Lennox zostaje znaleziona porzucona w swoim domu w brytyjskich Indiach, jej rodzice zmarli na cholerę, a ona jest zapomniana w zawirowaniach związanych z podziałem. Mary jest wysyłany do swojego wuja, Lord Archibald Craven’s Misselthwaite Manor w Yorkshire, Anglia. Ona jest nieprzyjemna, niemiła młoda dziewczyna, która miała do tłumienia własnych emocji podczas dorastania w Raj.
Po przybyciu, spotyka się z panią Medlock, surowy i stanowczy pani, która jest gosposią Lorda Cravena. Maryja jest poinstruowany, aby nie zbadać dom i jest ograniczony do jej pokoju w nocy. Tam spotyka Martę, służącą, która jest niezadowolona z jej wymagań.
Mary jest dozwolone opuścić dom, aby zbadać nieruchomości i lasy w pobliżu i natyka się na bezpańskiego psa, którego nazywa Jemima. Później tej nocy, słyszy drobne krzyki i zawodzenia w korytarzach tylko znaleźć Lorda Craven’s bedridden syna, Colin Craven.
Następnego dnia, Mary spotyka Lorda Cravena w jego gabinecie, a on mówi jej, aby nie powodować żadnych kłopotów. Mary kontynuuje eksplorację przez las i znajduje ukryty ogród wspinając się po ścianie. Później, w drodze do domu, ona woła do brata Marty Dickon, który zanika w mgle wrzosowisk. Później znajduje nogę Jemimy złapany w pułapkę. Ona pomaga Jemima, uwalniając ją z pułapki, ale pies ucieka do ogrodu. Tak, Maryja nadal explore.
Mary jest następnie prowadzony przez Robin do kamiennego posągu w ogrodzie, który ma klucz do ogrodu w nim. Ona opuszcza ogród jako pani Medlock woła do niej. Powrót na osiedlu, Maryja spotyka się z Colinem ponownie, jak mówi o posiadaniu garb i nie jest w stanie chodzić. Ona mówi mu o ogrodzie na osiedlu, ale Colin jest niezainteresowany. Snooping wokół później, ona znajdzie pokój ze zdjęciami zarówno matki Maryi i Grace Craven, a ona chwyta pamiątkę, naszyjnik z pereł.
Następnego dnia, Maryja wraca do ogrodu, aby znaleźć Dickon, który oferuje pomóc uzdrowić Jemima. Maryja następnie przynosi Colin w jego wózku inwalidzkim po raz pierwszy do tego samego pokoju z jego matki zdjęć i sukienki. Zarówno Maryja i Dickon wykluć plan przynieść Colin do ogrodu, mając nadzieję, że leczyć jego bezruch, ale po powrocie, pani Medlock konfrontuje Maryję za kradzież naszyjnik z pereł i jest karane przez zapisanie się do szkoły z internatem. Później, ograniczony i zamknięty w swoim pokoju, Mary znajduje listy między matką i ciotką w koniu na biegunach. Ona przekonuje Colin je przeczytać i trzy kontynuować czytanie listów w garden.
Przygnębiony i rozproszony Lord Craven, podczas zapalania świecy, ustawia biurko w ogniu. Następnego ranka, Mary, Dickon i Colin są w ogrodzie, kiedy widzą czarny dym pochodzący z domu. Colin przekonuje Mary i Dickon do uruchomienia, aby sprawdzić to. Mary wchodzi do płonącego domu, aby znaleźć pan Craven gorączkowo szuka jego syna w ogniu. Ona na próżno próbuje przekonać go do ucieczki, jak jego syn jest bezpieczny na zewnątrz, ale on opiera się aż duch jego żony prowadzi je bezpiecznie jako straż pożarna przybywa. Zaniepokojony Lord Craven i pani Medlock iść z Mary i Dickon do Colina w tajemniczym ogrodzie. Lord Craven spogląda z podziwem na mobilność syna, gdy na nowo rozpalają swój związek.
Film kończy się z Pan Craven odbudowy nieruchomości i Mary, Dickon i Colin zabawy w tajnym ogrodzie.
.