Na post-transcriptionele verwerking verlaat mRNA de celkern en bindt zich aan een ribosoom, een structuur bestaande uit eiwitten en RNA (rRNA) dat helpt bij het bindingsproces tussen mRNA codons en tRNA anticodons. Hoewel ribosomen slechts op één mRNA-streng tegelijk kunnen werken, kunnen meerdere ribosomen zich aan elke mRNA-streng binden om polyribosomen te vormen. Eukaryote en prokaryote ribosomen verschillen enigszins in hun grootte en complexiteit, hoewel hun functie over het algemeen vergelijkbaar is. Totdat we de specifieke eigenschappen van eukaryote translatie bespreken, zullen we het alleen hebben over prokaryote translatie.
Ribosoom Structuur
Ribosomen zijn samengesteld uit twee subeenheden, een kleine en een grote. Vier bindingsplaatsen bevinden zich op het ribosoom, één voor mRNA en drie voor tRNA. De drie tRNA-locaties zijn aangeduid met P, A en E. De P-locatie, de peptidyl-locatie genoemd, bindt zich aan het tRNA dat de groeiende polypeptideketen van aminozuren vasthoudt. De A-site (acceptor site) bindt aan het aminoacyl tRNA, dat het nieuwe aminozuur bevat dat aan de polypeptideketen moet worden toegevoegd. De E-site (exit-site) dient als drempel, de laatste tussenstap voordat een tRNA dat nu zijn aminozuur kwijt is, door het ribosoom wordt losgelaten.
Als de kleine subeenheid zich eenmaal met een mRNA-molecuul heeft geassocieerd, komen de twee subeenheden samen, waardoor een compactor ontstaat die het mRNA en tRNA in een stabiele en juiste oriëntatie houdt voor de eiwitsynthese.
Groei van het eiwit
Als we naar de chemische structuur van een aminozuur kijken, zien we dat het ene uiteinde een eindstikstofgroep bevat, terwijl het andere uiteinde een carboxylgroep bevat.
Wanneer aminozuren worden overgebracht van het aminoacyl tRNA in de A-locatie naar de groeiende eiwitketen die aan de P-locatie is bevestigd, worden zij in een specifieke oriëntatie overgebracht, zodat de keten groeit door aminozuren toe te voegen aan het carboxyl-, niet het stikstof-, uiteinde van de keten. Op deze manier groeit de eiwitketen in de stikstof-naar-carboxylrichting. Deze gesynthetiseerde keten wordt een polypeptideketen genoemd. Op dezelfde manier kan elk toegevoegd aminozuur een peptide worden genoemd; een bouwsteen van de grotere polypeptideketen. Eiwitten zijn polypeptiden.
