Critici van het zegel van de stad Southampton hebben een andere belangrijke discrepantie in het beeld van de Pilgrim over het hoofd gezien: De Engelsen die Southampton opeisten waren Puriteinen in plaats van Pelgrims. Southampton werd, net als Southold, East Hampton, Oyster Bay en Huntington, gesticht als een buitenpost van de New Haven Colony, die in 1638 werd gesticht door de Puriteinen John Davenport en Theophilus Eaton. Hoewel de Pilgrims soms zijn beschreven als extreme Puriteinen, wijst hun geschiedenis in Amerika op aanzienlijke verschillen tussen de twee.
Pilgrims waren separatisten die zich voor het eerst vestigden in Plymouth, Mass., in 1620 en later handelsposten vestigden aan de Kennebec Rivier in Maine, op Cape Cod en bij Windsor, Conn. Puriteinen waren niet-separatisten die zich in 1630 aansloten bij de migratie om de Massachusetts Bay Colony te stichten. Binnen 10 jaar vestigden Puriteinen zich in het grootste deel van Massachusetts, Connecticut en delen van Long Island.
Puriteinse separatisten verwierpen de Kerk van Engeland en de overblijfselen van het Katholicisme dat de Kerk van Engeland vertegenwoordigde. Puriteinse niet-separatisten waren weliswaar even vurig in hun religieuze overtuigingen, maar zetten zich in voor de hervorming van de Kerk van Engeland en het herstel van de vroeg-christelijke samenleving.
De praktische overwegingen van kolonisatie en de enorme uitgestrektheid van de oceaan tussen Engeland en Amerika veranderden uiteindelijk de verschillen tussen Pelgrims en Puriteinen in de Nieuwe Wereld. In 1691 werd Plymouth opgenomen in de Massachusetts Bay Colony.