NCBI では脊椎動物のオーソログ遺伝子を検索する新しい方法をテスト中です。 オーソログを検索するには、遺伝子記号（例：RAG1）または遺伝子記号と分類群を組み合わせたもの（例：primate RAG1）を入力する。 サジェストメニューから一致するエントリーを選択するか、オーソログオプション（例：Rag1 orthologs）を選択すると全てのオーソログを見ることができます。 検索結果は、NCBI の Gene リソースから提供されるオルソログのセットへのリンクが返されます。 結果リンクをクリックすると、そのオルソロググループの情報が表示されます（図 1）。 脊椎動物からの RAG1 遺伝子のセットへのリンクを示す Rag1 オルソログの検索
オルソログ ページ (図 2) では、ダウンロードまたはアライメントのために転写物またはタンパク質配列を選択し、分類ツリーを使用して結果を絞り、種レベルまで掘り下げていくことができます。 BLAST や NCBI のゲノムブラウザである GDV へのリンクにより、より詳細な遺伝子情報を得ることができます。 また、選択した内容に基づいて、PubMed から文献に素早くアクセスできます。
図 2. 顎脊椎動物のRAG1オルソログのセットで、Gene、Reference Sequences、配列ダウンロード、アライメントへのリンクがある。 Literature タブでは、選択したオルソログに関連する PubMed の引用を提供します。 Taxonomy Tree では、アカゲザルのような特定の種の詳細な結果をすばやく見つけることができます。
orthogolous 遺伝子のセットを探している場合は、これを試して、あなたの考えを教えてください。 アップデートにご期待ください！
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