インドと同様、パキスタンは1947年8月に英連邦内のドミニオンとして独立を果たしました。 しかし、ムスリム同盟の指導者たちは、イギリス最後のインド総督であるマウントバッテン卿をパキスタンの最初の総督、つまり国家元首とすることを拒否し、インドの最高責任者とした議会とは対照的に、マウントバッテン卿をパキスタンの総督とした。 英国の策略を警戒し、独立前に与えられた「偉大なる指導者（Quaid-e Azam）」であるジンナーに報いるため、パキスタン人は彼を総督とし、党内の副官であるリアクアット・アリー・カーンが首相に任命された。 しかし、パキスタン最初の政権は、困難な課題を抱えていた。 イクバルの構想とは異なり、イスラム教徒が多数派を占める北西部とベンガル地方（ベンガル地方もインドとパキスタンに分割されていた）の領土と東部の2つの地域からパキスタンが形成されることになったのだ。 そのため、パキスタンの両翼は、約1,600kmのインド領を隔てており、両者の間に簡単な連絡路はなかった。 新政府の仕事をさらに複雑にしたのは、英領インドの富と資源がインドに与えられたという認識であった。 パキスタンは、特に分割直後の数ヶ月間、それを維持するための生の熱意をほとんど持っていなかった。 実際、パキスタンの存続が危ぶまれるほどであった。 英領インドでよく組織されていた州のうち、シンド、バロチスタン、北西辺境州の比較的後進的な地域だけが無傷でパキスタンにやってきたのです。 パンジャブ州とベンガル州は分割され、ベンガル州の場合は、人口密度の高い農村部の後背地以外をほとんど受け取らなかった。
新しく未熟なパキスタン政府のジレンマに拍車をかけたのが、独立直後の時期に隣国との戦争を誘発したカシミール地方の危機であった。 カシミール地方は、インドとパキスタンがそれぞれ自国を構成する領土とすることを意図しており、かつての侯国であったこの地域は、インドとパキスタンの支配下に置かれ、将来の紛争の火種となることが予想されたのである。 経済的にも、インドの工場からの資材がパキスタンから遮断され、新生パキスタンのわずかな工業、商業、農業に支障をきたすなど、絶望的な状況であった。 さらに、分離独立とその余波は、何百万人もの難民を生み出し、ひどい虐殺を伴っていた。 2015年〉カシミール地方での未解決の戦争と、両国の街角で繰り広げられる共同体の血の抗争の結果、インドとパキスタンはそれぞれ相手を宿命の敵と見なすようになった。 パキスタンはインドの物質的、財政的、軍事的資産の分割を予期していた。 しかし、実際には何もなかった。 ニューデリーは、英領インドの資産を敵国と分割して、両国の均衡を図ろうとは考えていなかった。 さらに、インドが地政学的に優位な立場にあり、とりわけパキスタンに流入する重要な河川を支配しているため、イスラム教国の水源は敵対する大きな隣国のなすがままになっていたのである。 独立後のパキスタンの状況は非常に不安定であり、多くのオブザーバーは、パキスタンは半年も生き延びることができないと考え、インドが亜大陸の統一を目指すことは明確な可能性として残っていると考えていた
。