二次構造:β-プリーツシート

この構造は、ポリペプチド鎖の2つ(またはそれ以上、たとえばψ-ループ)セグメントが互いに重なり、互いに水素結合の列を形成したときに発生します。 これは、平行配列:

または反平行配列:

平行および反平行配列は、ポリペプチド鎖の方向性の直接的結果で起こり得る。 反平行配列では、一方のセグメントのC末端は他方のセグメントのN末端と同じ側にある。 平行配列の場合、C末端とN末端は両方のセグメントで同じ側にある。

平行配列は、個々のアミノ酸分子の形状が水素結合を斜めに発生させ、水素結合が長くなり、その結果弱くなるので、安定性が低くなる。

一般に、反平行ベータプリーツシートは、ポリペプチド鎖が方向を急激に反転するときに形成される。 これは2つの連続したプロリン残基の存在下で起こり、ポリペプチド鎖に角度のついたキンクを作り、それ自身の上に曲げ戻す。 これは、ポリペプチド鎖が遠くにある場合は必要ないが、近くにある場合は必須である。 短い距離では、βプリーツシートの2つのセグメントは4+2nのアミノ酸残基で隔てられており、4が最小の残基数である

コメントを残す

メールアドレスが公開されることはありません。