胚、若い、または半成長のワニの表皮は短い、円筒形の細胞の単一の層であるMalpighiiのteを含んでいます。 その上に、やや扁平な円盤状の細胞があり、その下層の細胞が横方向に分裂して形成されたものです。 その外側には、多角形の細胞がモザイク状に並ぶ上皮層があり、その中央付近に楕円形の核を持つ。 上皮細胞の間には、植物組織の表皮にある気孔のような小さな楕円形の穴が開いている。 角層は強く扁平な細胞からなり，核はもはやはっきり見ることはできないが，その位置は通常，色素顆粒群によって決定することができる。 また，より表層の細胞には，まっすぐな暗色の線があり，おそらく多角形の細胞の上か下かに圧迫されてできた隆起であろう。 腹部や頸部では、角質層の個々の細胞は容易に分離され、あまり厚くならないが、背部では、この層の細胞は非常に多く、互いに融合して骨板を形成しており、ここでは、硬膜が唯一の明確に分化した層である。
Rathkeは、すべてのワニ類において、特に顎の領域における表皮の特定のひだの表面に、ある種の小さな、散在した、いぼ状の隆起が見られ、それぞれの周囲には、通常、狭く、浅い、円形の溝があり、それらは通常暗褐色をしているが、時には灰色、あるいは白色にさえなっていることを指摘した。 顕微鏡で見ると，これらのいぼは表皮由来のもので，明るく丸い細胞が密接に結合しており，細胞間物質が見えない。 水酸化カリウムで処理した後、水で処理すると、常にではないが、細胞内に細かい粒状の核が見られることがある。 ワニ属のおそらくすべての動物では、少なくとも頸部と体幹の右側と左側の厚板に、皮膚腺の開口部のような外観を持つ、小さくて平らな穴が見られる。 この穴は喉の鱗，頸部側面下，体側面，尾の前方半分の側面と腹面，脚にもある。 鱗片の後縁に近いところにある。 ごくまれに1枚の鱗の中に2つのピットが見られることがある。 この孔はガビアルでは見られるが、いくつかの、おそらくすべてのワニでは見られない。 いくつかの孔の中央には小さなコブが突き出る。 これらの孔は腺の開口部ではないが、頭部に見られる孔とほぼ同じ構造をしている。
クロコダイル科の獣骨は、皮の結合組織から発生する。 若い動物で調査したところ、これらの骨は通常、表皮の下層と中層に起源を持ち、一般に周辺に向かって働くことがわかりました。