A NCBI új módszert tesztel az ortológ gerinces gének megtalálására és visszakeresésére. Az ortológok megtalálásához adjon meg egy génszimbólumot (pl. RAG1) vagy egy génszimbólumot egy rendszertani csoporttal kombinálva (pl. főemlős RAG1). Válassza ki a megfelelő bejegyzést a javaslatok menüből, vagy válassza az ortológok opciót (pl. Rag1 ortológok) az összes ortológ megtekintéséhez. A keresése egy találati linket fog visszaadni az NCBI Gene erőforrás által biztosított ortológok készletéhez. Kattintson az eredményhivatkozásra az adott ortológ csoportra vonatkozó információk megtekintéséhez (1. ábra).
1. ábra. A Rag1 ortológok keresése, amely a gerincesekből származó RAG1 gének halmazára mutató linket mutatja.
Az ortológ oldal (2. ábra) segítségével választhat transzkript- vagy fehérjeszekvenciákat letöltéshez vagy illesztéshez, a taxonómiafa segítségével finomíthatja az eredményeket, és fúrhat le a fajok szintjére. Részletesebb géninformációkat talál a BLAST és a GDV, az NCBI genomböngészője linkjeivel. Emellett gyors hozzáférést kap a PubMed irodalomhoz is a kiválasztása alapján.
2. ábra. Az állkapocsgerincesek RAG1 ortológjainak halmaza a génre, a referenciaszekvenciákra, a szekvencia letöltésére és az összehangolásra mutató linkekkel. Az Irodalom fül a kiválasztott ortológokra vonatkozó PubMed idézeteket tartalmazza. A Taxonómiafa lehetővé teszi, hogy gyorsan részletes eredményeket találjon egy adott fajra, például a Rhesus majomra vonatkozóan.
Ha ortológ gének készletét keresi, próbálja ki ezt, és ossza meg velünk a véleményét. Maradjon velünk a frissítésekért!