A Southampton város pecsétjének kritikusai figyelmen kívül hagytak egy másik jelentős eltérést a zarándok képében: A Southamptonra igényt tartó angolok inkább puritánok voltak, mint zarándokok. Southampton, akárcsak Southold, East Hampton, Oyster Bay és Huntington, a New Haven kolónia előőrseként jött létre, amelyet 1638-ban John Davenport és Theophilus Eaton puritánok alapítottak. Bár a zarándokokat néha szélsőséges puritánoknak nevezik, amerikai történelmük jelentős különbségeket mutat a kettő között.
A zarándokok szeparatisták voltak, akik először 1620-ban telepedtek le a massachusettsi Plymouthban, majd később kereskedelmi állomásokat létesítettek a Kennebec folyón Maine-ben, Cape Codon és Windsor közelében, Connban. A puritánok nem szeparatisták voltak, akik 1630-ban csatlakoztak a Massachusetts-öböl gyarmatát létrehozó népvándorláshoz. A puritánok 10 éven belül Massachusetts, Connecticut és Long Island területeinek nagy részét benépesítették.
A puritán szeparatisták elutasították az anglikán egyházat és a katolicizmus maradványait, amelyeket az anglikán egyház képviselt. A puritán nem-szeparatisták, bár vallási meggyőződésükben ugyanolyan buzgóak voltak, elkötelezettek voltak az anglikán egyház reformációja és az őskeresztény társadalom helyreállítása mellett.
A gyarmatosítás gyakorlati megfontolásai és az Anglia és Amerika közötti hatalmas óceáni kiterjedés végül megváltoztatta a zarándokok és puritánok közötti különbségeket az Újvilágban. 1691-ben Plymouthot a Massachusetts-öböl gyarmatához csatolták.