NCBI testaa uutta tapaa löytää ja hakea ortologisia selkärankaisten geenejä. Ortologien löytämiseksi anna geenisymboli (esim. RAG1) tai geenisymboli yhdistettynä taksonomiseen ryhmään (esim. primate RAG1). Valitse sopiva merkintä ehdotukset-valikosta tai voit valita ortologit-vaihtoehdon (esim. Rag1-ortologit) nähdäksesi kaikki ortologit. Hakusi palauttaa tuloslinkin NCBI:n Gene-resurssin tarjoamiin ortologeihin. Napsauta tuloslinkkiä nähdäksesi kyseisen ortologiryhmän tiedot (kuva 1).
Kuva 1. Tulokset. Rag1-ortologien haku, jossa näkyy linkki selkärankaisista peräisin olevien RAG1-geenien joukkoon.
Ortologisivulla (kuva 2) voit valita transkriptio- tai proteiinisekvenssejä ladattavaksi tai kohdistettavaksi, käyttää taksonomiapuuta tuloksien tarkentamiseen ja porautua lajitasolle. Löydät yksityiskohtaisempia geenitietoja linkkien avulla BLASTiin ja GDV:hen, NCBI:n genomiselaimeen. Saat myös nopean pääsyn kirjallisuuteen PubMedistä valintasi perusteella.
Kuva 2. RAG1:n ortologien joukko leukaselkärankaisille selkärankaisille sekä linkit geeniin, referenssisekvensseihin, sekvenssin lataamiseen ja kohdistukseen. Literature-välilehdeltä löytyvät relevantit PubMed-sitaatit valituille ortologeille. Taxonomy Tree -toiminnon avulla voit nopeasti löytää yksityiskohtaisia tuloksia tietylle lajille, kuten Rhesus apinalle.
Jos etsit ortologisten geenien joukkoa, kokeile tätä ja kerro meille mielipiteesi. Pysy kuulolla päivityksiä varten!