Käsitteellä morfologia viitataan biologiassa eliön muotoon, rakenteeseen ja konfiguraatioon.Tämä käsittää sekä ulkoisen olemuksen (muoto, rakenne, väri, kuvio) että sisäisten osien, kuten luiden ja elinten, muodon ja rakenteen. Tämä eroaa fysiologiasta, joka käsittelee ensisijaisesti toimintaa.
Morfologia on biotieteiden osa-alue, joka käsittelee eliön tai taksonin ja sen osien karkean rakenteen tutkimusta. Se voidaan jakaa kahteen eri haaraan: Anatomia on eliön rakenteen ja sisäelinten tutkimusta. Eliön ulkoisen olemuksen tutkimusta kutsutaan eidonomiaksi, mutta vaikka se olikin biologian historian alkupuolella hallitsevassa asemassa, sitä tutkitaan nykyään vain vähän, koska se on kypsynyt konvergentin evoluution vaikutusten vuoksi. Se tuottaa siten vähemmän uutta tietoa eliöistä kuin anatomia, ja siksi eliöiden ulkoista olemusta tutkitaan yleensä osana yleisiä morfologian tutkimuksia, esimerkiksi fylogeneettisen tutkimuksen yhteydessä.
Käytössä on myös termi ”bruttomorfologia”, jolla tarkoitetaan eliön tai taksonin morfologian näkyviä tai pääasiallisia piirteitä. Eliön karkean morfologian kuvaus sisältää esimerkiksi sen yleisen muodon, yleisen värin, tärkeimmät merkit jne. mutta ei hienompia yksityiskohtia.
Useimmat taksonit eroavat morfologisesti muista taksoneista. Tyypillisesti läheisesti sukua olevat taksonit eroavat toisistaan paljon vähemmän kuin kauempana sukua olevat, mutta tästä on poikkeuksia. Kryptiset lajit ovat lajeja, jotka näyttävät hyvin samankaltaisilta tai ehkä jopa ulkoisesti identtisiltä, mutta ovat lisääntymisteknisesti eristyksissä. Sitä vastoin joskus toisiinsa liittymättömät taksonit saavat samankaltaisen ulkonäön yhtenevän evoluution tai jopa matkimisen kautta. Morfologisiin tietoihin tukeutumisen ongelmana on myös se, että se, mikä saattaa morfologisesti näyttää kahdelta erilliseltä lajilta, voi itse asiassa DNA-analyysin perusteella osoittautua yhdeksi lajiksi.