NCBI testar ett nytt sätt att hitta och hämta ortologa gener från ryggradsdjur. För att hitta ortologer anger du en gensymbol (t.ex. RAG1) eller en gensymbol i kombination med en taxonomisk grupp (t.ex. primat RAG1). Välj den matchande posten från menyn med förslag eller välj alternativet ortologer (t.ex. Rag1-ortologer) för att se alla ortologer. Din sökning kommer att ge en resultatlänk till den uppsättning ortologer som tillhandahålls av NCBI:s genresurs. Klicka på resultatlänken för att se information om den ortologgruppen (figur 1).
Figur 1. Sökning efter Rag1-ortologer som visar länken till uppsättningen RAG1-gener från ryggradsdjur.
På ortologsidan (figur 2) kan du välja transkript- eller proteinsekvenser för nedladdning eller anpassning, använda taxonomiträdet för att förfina dina resultat och borra ner till artnivå. Du hittar mer detaljerad geninformation med länkar till BLAST och GDV, NCBI:s genombrowser. Du får också snabb tillgång till litteratur från PubMed baserat på ditt urval.
Figur 2. Uppsättningen av RAG1-ortologer för vertebrater med käkar med länkar till gen, referenssekvenser, nedladdning av sekvenser och anpassning. Under fliken Litteratur finns relevanta PubMed-citat för de valda ortologerna. Med Taxonomy Tree kan du snabbt hitta detaljerade resultat för en viss art, t.ex. Rhesusapa.
Om du letar efter en uppsättning ortologer kan du prova detta och låta oss veta vad du tycker. Håll dig uppdaterad!