Nästan alla cytokiner förmedlar biologiska aktiviteter antingen direkt på immunceller eller på de adhesionsmolekyler som immuncellerna interagerar med och kan därför betraktas som proinflammatoriska. Flera cytokiner, däribland tumörnekrosfaktor (TNF), interleukin (IL)-1, IL-6 och medlemmar av den lilla cytokinfamiljen, har en unik förmåga att främja det cellinfiltrat och den skada på inhemsk vävnad som är karakteristiska för inflammation. Biologi och tekniker för analys av dessa cytokiner beskrivs. Bioassays var de tidigaste metoderna för att karakterisera cytokiner. Även om bioassays kan vara känsligare än immunbaserade tester kan de kanske inte skilja mellan cytokiner med korsreagerande aktiviteter. Dessutom kan bioassays vara falskt negativa om det finns hämmare. Det är dock fortfarande användbart att analysera cytokiner utifrån deras biologiska aktivitet. ELISA-test skiljer inte biologiskt aktiva från inaktiva men immunoreaktiva former av proteinerna. Eftersom bioassays endast upptäcker funktionell aktivitet kan de vara användbara för att identifiera cytokinantagonister i en reaktionsblandning. Den molekylära kloningen av cDNA:er för cytokiner och utvecklingen av storskaliga uttrycksmetoder har gjort det möjligt att få tillgång till praktiskt taget obegränsade mängder protein för biologiska analyser. Renade proteiner har också använts för att utveckla immunbaserade testmetoder, t.ex. ELISA för kvantifiering av cytokiner. ELISA är den bästa och i många fall den enda mekanismen för att särskilja cytokiner med betydande överlappande biologiska aktiviteter. Isolering av cytokinspecifika cDNA:er gör det möjligt att använda molekylära tekniker för att identifiera cytokinspecifika mRNA-transkriptioner. En extremt känslig teknik för att upptäcka transkript är den RNA-baserade polymeraskedjereaktionen (RT-PCR). Biologiska tester för IL-1, IL-6, IL-8 och TNF är väl standardiserade och beskrivs här. De allmänna teknikerna för ELISA och RT-PCR beskrivs också.