Masacrul de la Glen Coe
Revoluția din Anglia a fost realizată aproape fără vărsare de sânge, dar în Scoția și Irlanda a existat rezistență armată. Aceasta s-a prăbușit în Scoția în 1689, dar țara a rămas tulbure și neliniștită pe toată durata domniei lui William. În 1692, Alexander MacDonald din Glen Coe și unii dintre membrii clanului său au fost uciși cu sânge rece pentru că au întârziat să depună jurământul de credință față de William. William a ordonat o anchetă, dar nu a luat nicio măsură până când, în 1695, Parlamentul scoțian a cerut o anchetă publică. Ulterior, el a dat dovadă de o clemență vinovată față de infractori, limitându-se să îl demită din funcția de secretar pe Sir John Dalrymple, căruia i s-a atribuit în cele din urmă responsabilitatea pentru masacru. În Irlanda, războiul a izbucnit în mod oficial în 1689, când Iacob a debarcat acolo cu sprijin francez. Însă apărarea cu succes a orașelor Londonderry și Enniskillen, precum și victoria lui William în Bătălia de la Boyne, la 1 iulie 1690, au asigurat recucerirea Irlandei și l-au eliberat pentru a-și îndrepta atenția către continentul european. Aici, după o serie de atacuri minore asupra imperiului, Ludovic al XIV-lea a invadat Palatinatul în 1688. Olandezii și împăratul au încheiat Tratatul de la Viena (mai 1689) și i-au declarat război lui Ludovic; în următoarele 18 luni, rarele abilități diplomatice ale lui William au adus în alianță Brandenburg, Hanovra, Saxonia, Bavaria, Savoia și Spania, precum și Anglia, care a devenit pivotul acesteia.
Din 1691, William a petrecut mult timp făcând campanie pe continent, cu diferite grade de succes, dar până în 1696 o serie de factori au făcut ca ambele părți să fie nerăbdătoare să facă pace, iar Tratatele de la Rijswijk au fost semnate în 1697. Cu toate acestea, problema, vitală pentru echilibrul de putere european, a celui care urma să îi succeadă regelui fără copii Carol al II-lea al Spaniei a rămas nesoluționată, iar William avea motive întemeiate să se teamă că pacea nu va fi mai mult decât un armistițiu. Parlamentul englez, dimpotrivă, era convins că aceasta va fi de durată, a insistat asupra reducerii dimensiunii armatei și a întors cu hotărâre spatele afacerilor externe. William, în speranța de a evita un nou război, a încheiat cu Ludovic două tratate de împărțire a Spaniei (1698-99) – măsuri care l-au implicat în fricțiuni serioase cu Parlamentul. Dar când regele spaniol a murit la 1 noiembrie 1700, Ludovic, ignorând acordurile sale, a acceptat coroana Spaniei pentru nepotul său și a arătat curând că nu renunțase la planurile sale de mărire a Franței.
William, deși împiedicat de apatia englezilor, s-a apucat să reconstruiască Marea Alianță și să pregătească cele două țări pentru conflictul acum inevitabil. În septembrie 1701, Iacob al II-lea, aflat în exil, a murit, iar Ludovic al XIV-lea l-a proclamat pe fiul său rege al Angliei, contrar celor convenite într-unul dintre tratatele de la Rijswijk, stârnind astfel entuziasmul englezilor pentru război. William nu a trăit pentru a vedea acest război declarat. Sănătatea sa era de mult timp în declin, iar în martie 1702 a murit. Planurile sale pentru o așezare europeană au fost în mare parte puse în aplicare prin Tratatul de la Utrecht (1713). Idealul său, pe care l-a urmărit cu perseverență timp de 30 de ani, era o ordine internațională în care nicio putere să nu fie capabilă să le tiranizeze pe celelalte
.