Căutarea de gene ortologe la NCBI

NCBI testează un nou mod de a găsi și prelua genele vertebrate ortologe. Pentru a găsi orthologii introduceți un simbol de genă (de exemplu, RAG1) sau un simbol de genă combinat cu un grup taxonomic (de exemplu, primate RAG1). Selectați intrarea corespunzătoare din meniul de sugestii sau puteți selecta opțiunea orthologs (de exemplu, Rag1 orthologs) pentru a vedea toți orthologii. Căutarea dvs. va returna un link de rezultate către setul de ortologi furnizat de resursa Gene a NCBI. Faceți clic pe linkul de rezultate pentru a vedea informațiile pentru acel grup de ortologi (Figura 1).

Figura 1. Căutarea orthologilor Rag1 care arată linkul către setul de gene RAG1 de la vertebrate.

În pagina orthologilor (Figura 2), puteți selecta secvențe de transcriere sau de proteine pentru descărcare sau aliniere, puteți utiliza arborele taxonomic pentru a vă rafina rezultatele și puteți detalia până la nivelul speciilor. Veți găsi informații mai detaliate despre gene, cu linkuri către BLAST și GDV, browserul de genom al NCBI. De asemenea, obțineți acces rapid la literatura de specialitate din PubMed în funcție de selecția dvs. Setul de ortologi RAG1 pentru vertebrate cu maxilar, cu link-uri către Gene, secvențe de referință, descărcare de secvențe și aliniere. Fila Literature (Literatură) oferă citate PubMed relevante pentru ortologii selectați. Arborele de taxonomie vă permite să găsiți rapid rezultate detaliate pentru o anumită specie, cum ar fi maimuța Rhesus.

Dacă sunteți în căutarea unui set de gene ortogole, încercați acest lucru și anunțați-ne ce părere aveți. Rămâneți pe fază pentru actualizări!

Lasă un răspuns

Adresa ta de email nu va fi publicată.