NCBI está a testar uma nova forma de encontrar e recuperar genes de vertebrados ortológicos. Para encontrar ortologs digite um símbolo de gene (por exemplo, RAG1) ou um símbolo de gene combinado com um grupo taxonômico (por exemplo, RAG1 de primatas). Selecione a entrada correspondente no menu de sugestões ou você pode selecionar a opção ortologs (por exemplo, ortologs Rag1) para ver todos os ortologs. A sua pesquisa irá retornar um link de resultados para o conjunto de ortologs fornecidos pelo recurso Gene do NCBI. Clique no link de resultados para ver informações para esse grupo de ortologs (Figura 1).
Figure 1. Procure por ortologs Rag1 mostrando o link para o conjunto de genes RAG1 dos vertebrados.
Na página do ortolog (Figura 2), você pode selecionar transcrições ou seqüências de proteínas para download ou alinhamento, use a árvore de taxonomia para refinar seus resultados, e faça o drill down para o nível da espécie. Você encontrará informações genéticas mais detalhadas com links para BLAST e GDV, o navegador do genoma da NCBI. Você também obtém acesso rápido à literatura do PubMed com base em sua seleção.
Figure 2. O conjunto de ortologs RAG1 para vertebrados de mandíbula com links para Gene, Sequências de Referência, download de sequência e alinhamento. O separador Literatura fornece citações relevantes do PubMed para os ortologs seleccionados. A Árvore da Taxonomia permite que você encontre rapidamente resultados detalhados para uma espécie específica como o macaco Rhesus.
Se você estiver procurando por um conjunto de genes ortogólios, experimente isto e nos deixe saber o que você pensa. Fique atento para atualizações!