O termo morfologia em biologia refere-se à forma, estrutura e configuração de um organismo, incluindo aspectos da aparência externa (forma, estrutura, cor, padrão) bem como a forma e estrutura das partes internas como ossos e órgãos. A morfologia é um ramo da ciência da vida que lida com o estudo da estrutura bruta de um organismo ou taxon e suas partes componentes. Pode ser subdividido em dois ramos distintos: a anatomia é o estudo da estrutura e dos órgãos internos de um organismo. O estudo da aparência externa de um organismo é chamado de eidonomia, mas embora predominante no início da história da biologia, é pouco estudado em particular por estar maduro com os efeitos da evolução convergente. Assim, produz menos informação nova sobre os organismos do que a anatomia e, portanto, a aparência externa das formas de vida é geralmente estudada como parte de investigações gerais em morfologia, por exemplo, no contexto da pesquisa filogenética.
Também em uso está o termo “morfologia bruta”, que se refere aos aspectos proeminentes ou principais da morfologia de um organismo ou táxon. Uma descrição da morfologia bruta de um organismo incluiria, por exemplo, sua forma geral, cor geral, marcas principais, etc., mas não detalhes mais finos.
Muitos táxons diferem morfologicamente dos outros táxons. Tipicamente, os táxons estreitamente relacionados diferem muito menos do que os mais distantes, mas há exceções a isso. Espécies crípticas são espécies que parecem muito semelhantes, ou talvez até mesmo exteriormente idênticas, mas são reproduzivelmente isoladas. Pelo contrário, às vezes os taxa não relacionados adquirem aparência semelhante através da evolução convergente ou mesmo através da mímica. Um outro problema em confiar em dados morfológicos é que o que pode parecer, morfologicamente falando, ser duas espécies distintas, pode de fato ser mostrado pela análise de DNA como sendo uma única espécie.