Anos anteriores
Pederson nasceu em Bellingham, Washington, em 1968. Frequentou a Escola Secundária Ferndale, nas proximidades de Ferndale, Washington, e foi uma seleção All-State no futebol, basquetebol e beisebol. Após o ensino médio, formou-se na Northeast Louisiana University, onde foi quarterback de 1987 a 1990. Ele ainda detém vários recordes de passes na escola.
Profissional
Miami Dolphins
Pederson assinou originalmente como agente livre de novatos pelos Miami Dolphins em 1 de maio de 1991, fora da Northeast Louisiana University (agora University of Louisiana at Monroe) em Monroe, Louisiana. Ele foi dispensado em 17 de agosto de 1991, antes do início da temporada regular. Depois de passar a temporada de 1991 como agente livre, o New York/New Jersey Knights of the World League of American Football (WLAF) o convocou na quinta rodada para o primeiro grupo de jogadores qualificados no dia 4 de fevereiro de 1992. O segundo grupo, que foi redigido a partir de 20 de fevereiro, consistia de jogadores alocados pelas equipes da NFL para o campeonato. Ele foi o quarterback reserva do Reggie Slack com os Knights de março a maio de 1992.
Após o término da temporada da WLAF, ele foi reassinado pelos Dolphins em 2 de junho de 1992. Pederson passou o campo de treino de 1992 com os Golfinhos, antes de ser libertado durante os cortes finais do plantel novamente. Posteriormente ele foi reassinado para a equipe de treinos da equipe, onde treinou na equipe de escoteiros até ser dispensado em 8 de outubro de 1992. Ele foi reassinado pelos Golfinhos após a temporada, em 3 de março de 1993. Após seu terceiro treino com os Golfinhos, ele foi novamente dispensado em 31 de agosto de 1993. Pela segunda temporada consecutiva, Pederson foi reassinado para a equipe de treinos da equipe, em 1 de setembro de 1993. Dan Marino, quarterback titular dos Dolphins desde 1983, rompeu o tendão de Aquiles em um jogo da semana 6 contra o Cleveland Browns, em 10 de outubro de 1993, forçando o reforço Scott Mitchell a substituí-lo. Pederson substituiu Marino na lista ativa, e serviu como reforço de Mitchell para os próximos quatro jogos. Pederson fez sua estréia na NFL em 24 de outubro de 1993, em um jogo da semana 8 contra o Indianapolis Colts. Ele ajudou o treinador Don Shula a ganhar seu recorde de 325ª vitória na NFL como técnico quando Mitchell sofreu um ombro separado em um jogo da 11ª semana contra o Philadelphia Eagles, em 14 de novembro de 1993. Naquele jogo de quebra de recorde para o treinador Shula, Pederson entrou no terceiro quarto de jogo e fez 3 a 6 por 34 jardas, além de ter completado vários downs cruciais no terceiro. Pederson foi capaz de conduzir os Dolphins à vitória. Pederson também serviu de apoio para a recente aquisição de Steve DeBerg para os três jogos que Mitchell falhou com uma lesão. Ele entrou brevemente em uma partida da semana 14 contra o New York Giants enquanto DeBerg estava recebendo pontos no rosto. Mitchell voltou como titular dos Dolphins após a semana 15, e Pederson foi liberado a favor de DeBerg e Hugh Millen, quarterback da terceira linha, em 16 de dezembro de 1993. Ele passou toda a temporada de 1994 no plantel ativo dos Dolphins como terceiro quarterback, atrás de Marino e Bernie Kosar. Em 15 de fevereiro de 1995, Pederson foi selecionado pelo Carolina Panthers na vigésima segunda rodada do NFL Expansion Draft, depois de ser colocado na lista de jogadores disponíveis dos Dolphins em 19 de janeiro, mas foi lançado em 24 de maio de 1995. Ele retornou à Liga Mundial após seu lançamento, jogando com Rhein Fire. Pederson voltou a assinar com os Golfinhos em junho de 1995. Depois de competir com Dan McGwire durante todo o campo de treino, Pederson foi dispensado em 22 de Agosto de 1995. Marino sofreu uma lesão no joelho durante um jogo da semana 6, então Pederson foi reassinado em 10 de outubro para servir como o terceiro quarterback atrás de Kosar e McGwire para os dois jogos seguintes. Ele foi liberado novamente depois que Marino retornou para a semana 9 em 24.
Primeira temporada com Packers
Pederson trabalhou para o Green Bay Packers após a semana 10 em 1995, devido a uma lesão no final da temporada sofrida pelo reserva Ty Detmer e uma pequena lesão sofrida pelo titular Brett Favre. O terceiro quarterback T. J. Rubley foi forçado a jogar na semana 10 e fez uma intercepção de fim de jogo depois de chamar um audível, indo contra o playcall do treinador Mike Holmgren. O Packers contratou Bob Gagliano para ser o quarterback de terceira linha durante as semanas 11 e 12. Pederson substituiu Gagliano como quarterback de terceira linha quando assinou com o Packers em 22 de novembro de 1995. Os Packers reivindicaram a renúncia de Jim McMahon dos Browns para servir como reserva do Favre à frente de Pederson e Rubley em 29 de novembro de 1995. Rubley foi dispensado em 13 de dezembro, deixando McMahon e Pederson como backups do Favre. Favre não perdeu nenhum jogo, então Pederson não viu nenhuma ação de jogo para os Packers em 1995. Pederson foi o terceiro quarterback atrás de Favre e McMahon em 1996, jogando em um jogo, mas não registrou estatísticas. Ele recebeu um anel do Super Bowl após a vitória dos Packers sobre os Patriots no Super Bowl XXXI. Ele assinou novamente com os Packers com um contrato de dois anos em 20 de fevereiro de 1997. Pederson foi novamente o terceiro quarterback ao longo de 1997, apoiando Favre e Steve Bono. Pederson bateu Rick Mirer para o cargo de reserva do Favre, bem como para o de titular do primeiro lugar, em 1998. Em uma semana de 5 derrotas para o Minnesota Vikings, Pederson substituiu Favre nos últimos cinco minutos de um jogo eliminatório, e jogou dois touchdowns no seu lugar. No entanto, Pederson sofreu um maxilar quebrado que o derrubou para os próximos quatro jogos do time.
Philadelphia Eagles
Pederson assinou um contrato de três anos, $4,5 milhões com o Philadelphia Eagles em 18 de fevereiro de 1999, para se tornar o quarterback titular do time sob o novo técnico Andy Reid, que foi o treinador de quarterbacks de Pederson em Green Bay de 1997 a 1998. Os Eagles convocaram Donovan McNabb com a segunda escolha geral no draft da NFL de 1999, em abril de 1999, e Reid disse que Pederson permaneceria como titular até que McNabb estivesse pronto para jogar. Em suas nove partidas para os Eagles, Pederson tinha um recorde de 2-7, uma taxa de finalização de 51,6%, 1.168 jardas de passes, seis touchdowns e nove interceptações. Em seu primeiro início de carreira, um jogo de uma semana contra o Arizona Cardinals, Pederson fez dois touchdowns no primeiro trimestre para ajudar a dar aos Eagles uma vantagem de 21-0. Os Cardinals voltaram, no entanto, e venceram o jogo em um gol de campo, com o tempo expirado, 25-24. Pederson foi 12 por 25 durante 91 jardas e dois touchdowns no jogo. McNabb substituiu Pederson, que sofreu uma contusão no ombro, depois de uma derrota de 2 a 1 para os Tampa Bay Buccaneers, na qual Pederson foi 12 de 19 por 100 jardas e uma interceptação. Pederson começou uma semana com 3 derrotas (26-0) para os Buffalo Bills, indo 14-de-26 por 137 jardas e dois fumbles perdidos, antes de ser substituído por McNabb novamente no quarto trimestre. Numa semana de 4 derrotas para o New York Giants, Pederson foi 6 por 15 por 75 jardas e duas interceptações antes de ser substituído por McNabb após o intervalo. A primeira vitória de Pederson na NFL veio na semana 5 em um jogo contra os Dallas Cowboys. Ele jogou o jogo inteiro, indo 11 de 29 por 145 jardas, um touchdown, e uma interceptação. Pederson jogou a totalidade dos três jogos seguintes, batendo um recorde de 1-2 enquanto lançava três touchdowns e três interceptações. Na sua partida final como Águia, Pederson foi colocado no intervalo de uma semana, 9 partidas contra os Carolina Panthers, depois de ter ido 3-de-9 por 28 jardas e ter perdido 23-0. Ele não voltou a ver ação no jogo do quarterback até um jogo da semana 14 contra os Cowboys, no qual McNabb sofreu uma lesão no quarto trimestre. Pederson foi 8-for-12 por 108 jardas e um touchdown na derrota, e Koy Detmer recebeu o início à sua frente na semana 15, com McNabb ainda lesionado. Após passar o treino da temporada seguinte com a equipa, os Eagles libertaram Pederson em 28 de Agosto de 2000.
Cleveland Browns
Pederson considerou a reforma depois de ser libertado pelos Eagles, mas em vez disso assinou um contrato de dois anos com os Cleveland Browns em 2 de Setembro de 2000. O backup dos Browns, Ty Detmer, sofreu uma lesão no final da temporada, e os Browns precisavam de um quarterback de reserva para iniciar Tim Couch. Esta foi a segunda vez na carreira de Pederson que ele foi contratado para substituir um Ty Detmer lesionado. Pederson começou como o terceiro quarterback atrás de Couch e Spergon Wynn, até Couch sofrer uma lesão no final da temporada na semana 7. Pederson começou as seis partidas seguintes, batendo um recorde de 1-5. Em um jogo da semana 13 contra o Baltimore Ravens, ele foi eliminado do jogo com costelas machucadas e substituído por Wynn. Wynn começou na semana seguinte contra os Jacksonville Jaguars, mas sofreu uma lesão no final da temporada e Pederson o substituiu. Pederson voltou para os dois últimos jogos da temporada, perdendo ambos, incluindo uma derrota de 35-24 para sua antiga equipe, os Eagles, e uma derrota de 24-0 para os Titãs do Tennessee. Pederson foi lançado após a temporada em 22 de fevereiro de 2001.
Green Bay Packers (segundo stint)
Os Packers assinaram novamente Pederson para um contrato de um ano em 13 de março de 2001, para substituir Matt Hasselbeck, que foi negociado com o Seattle Seahawks. Pederson foi o backup principal do Favre durante toda a temporada de 2001, e foi o principal titular em todos os jogos. Ele foi reassinado para um contrato de um ano, $650.000 com os Packers em 2 de abril de 2002. Pederson foi novamente o quarterback de reserva e titular primário em todos os 16 jogos em 2002. Em um jogo da semana 7 contra o Washington Redskins, Favre sofreu uma entorse no joelho e Pederson tirou a maior parte dos “snaps” no segundo tempo, indo 9 por 15 por 78 jardas para ajudar a ganhar o jogo 30-9. Pederson também jogou em jogos contra os Miami Dolphins, Detroit Lions e New York Jets. Ele assinou novamente com os Packers para um contrato de US$ 750.000 por um ano em 29 de abril de 2003. Pela terceira temporada consecutiva, Pederson apoiou o Favre em todos os 16 jogos e ocupou os lugares. Ele completou os dois passes durante a temporada regular por um total de 16 jardas. O Packers assinou um contrato de um ano com o Pederson no dia 28 de abril de 2004. Tim Couch foi assinado para concorrer ao cargo de quarterback reserva, mas perdeu para Pederson e foi liberado em 5 de setembro de 2004. Em um jogo da semana 3 contra o Indianapolis Colts, Pederson substituiu Favre em uma derrota e foi 4 de 6 por 34 jardas e uma interceptação. Na semana seguinte, um jogo da semana 4 contra o New York Giants, Favre sofreu uma contusão no terceiro trimestre, e Pederson o substituiu no quarterback. Pederson foi 7-de-17 por 86 jardas e uma interceptação na derrota antes de sofrer uma pancada no seu lado no terceiro trimestre que resultou em um osso rachado nas costas, um músculo rasgado no seu lado e uma costela quebrada. Ele permaneceu no jogo até o último snap, quando foi substituído pelo quarterback Craig Nall, da terceira linha. Pederson foi colocado no reserva lesionado em 7 de outubro, encerrando sua temporada. Ele se aposentou em março de 2005 para se tornar treinador principal da Calvary Baptist Academy.